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細(xì)胞系的錯誤鑒定該如何解決

  • 發(fā)布日期:2019-03-12      瀏覽次數(shù):1497
    •   細(xì)胞系對于生物醫(yī)學(xué)研究是非常有價(jià)值的工具。然而,它們作為正常或患病組織模型的有效性有賴于它們真的是研究人員所認(rèn)為的組織類型和物種。不幸的是,據(jù)估計(jì)常用的細(xì)胞系中有14%~16%是被錯誤鑒別的。
        錯誤鑒別通常源于交叉污染(一種培養(yǎng)物被在同一實(shí)驗(yàn)室中培養(yǎng)的另一種細(xì)胞系接替),也可能源于細(xì)胞培養(yǎng)中的錯誤操作。*,迄今為止建立的個(gè)人類癌細(xì)胞系HeLa細(xì)胞具有頑強(qiáng)的生命力,它們甚至可以存活在氣溶膠液滴中并以此方式污染其它細(xì)胞。由于HeLa細(xì)胞生長得特別快,它們終會在數(shù)量上超過其它細(xì)胞。研究發(fā)現(xiàn)被錯誤鑒別的細(xì)胞系中有30%~50%是HeLa衍生物[2,3]。對于大多數(shù)錯誤鑒別的細(xì)胞系來說,再也找不到真實(shí)的儲備了。
        盡管從20世紀(jì)60年代以來人們已經(jīng)意識到了細(xì)胞系錯誤鑒別的問題,但這個(gè)問題仍然普遍存在。例如,在1968年HEp-2被證明是HeLa(宮頸癌細(xì)胞)衍生物,但每年仍有研究人員將其作為喉癌細(xì)胞系研究并發(fā)表論文[1]。在很長一段時(shí)間里,期刊和資助機(jī)構(gòu)都沒有適當(dāng)?shù)恼咭罂茖W(xué)家們對他們使用的細(xì)胞系進(jìn)行鑒定。在過去的十年中情況有所轉(zhuǎn)變,現(xiàn)在越來越多期刊要求或鼓勵作者進(jìn)行細(xì)胞系的鑒定[1,4],包括BioMedCentral的期刊、《International Journalof Cancer》、Nature出版集團(tuán)的期刊等等。由于這類期刊數(shù)量不斷增加且不同期刊之間要求各異,因此在提交論文前檢查特定期刊的指南非常重要。例如,除了細(xì)胞系鑒定的基本要求外,《Journal of Hepatology》還聲明它將不再考慮使用一些已知被錯誤鑒別的細(xì)胞系(BEL7402、SMMC7721、MHCC97L等等)。美國國立衛(wèi)生研究院是將細(xì)胞系鑒定作為資助條件的資助機(jī)構(gòu)之一。
        短串聯(lián)重復(fù)序列(shorttandem repeat)(STR)分析法是期刊接受的人類細(xì)胞系鑒定方法,這是一種用于法醫(yī)學(xué)的DNA指紋技術(shù)。它是一種基于PCR的技術(shù),該方法同時(shí)測試大量多態(tài)微衛(wèi)星位點(diǎn)。STR分析可以將細(xì)胞系匹配到供體(如果供體的STR圖譜是已知的話)或已知STR圖譜的細(xì)胞系。然而,如果特意從同一供體上建立了兩種以上細(xì)胞系,那么這兩種細(xì)胞系不能通過STR分析來區(qū)分。由于細(xì)胞傳代的遺傳漂變,所培養(yǎng)的細(xì)胞的STR圖譜可能不會與供體100%匹配。目前的標(biāo)準(zhǔn)是用≥80%的匹配來確認(rèn)細(xì)胞系的身份[5]。
        有關(guān)這一問題以及使用細(xì)胞系的推薦做法的更多信息,請查看細(xì)胞系認(rèn)證委員會(ICLAC)的網(wǎng)站。ICLAC提供當(dāng)前已知被錯誤鑒別的細(xì)胞系的索引,該索引現(xiàn)在列有488種細(xì)胞系。你還可以找到人類細(xì)胞系STR圖譜數(shù)據(jù)庫的鏈接以及關(guān)于此問題的許多其它的出版物和網(wǎng)址。
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